Smešteno u blizini grada Orahovca, oko 90 kilometara južno od Prištine, selo Velika Kruša je mjesto gdje su jugoslovenske snage u martu 1999. ubile 241 albanskog civila.
Posmrtni ostaci žrtava otkriveni su u godinama nakon rata u osam masovnih grobnica iskopanih oko sela. U najvećoj je bilo 58 tijela.
U presudi Međunarodnog krivičnog suda za bivšu Jugoslaviju (MKSJ) petorici visokih jugoslovenskih i srpskih državnih, vojnih i policijskih zvaničnika, kaže se da su 25. marta 1999. godine ili oko tog datuma, snage Savezne Republike Jugoslavije (SRJ) i Srbije napale sela Mala Kruša i Velika Kruša, koja su udaljena jedno od drugog oko jedan kilometar. Prema presudi, meštani sela Mala Kruša sklonili su se u šumovito područje izvan sela, odakle su mogli vidjeti kako snage SRJ i Srbije sistematski pljačkaju i pale njihove kuće.
MKSJ je saslušao više svjedoka koji su svjedočili o ubistvima, odrubljivanju glava, silovanju i mučenju u selu. Srpske snage su digle u vazduh i seosku džamiju.
Prema svjedočenjima, kao i izvještajima međunarodnih nevladinih organizacija, srpska policija je pokušala da sakrije ubistva spaljivanjem tijela ili njihovo uklanjanje kamionima i drugim vozilima. Mještani su vidjeli policiju kako baca mrtva tijela u obližnju rijeku. Prema OSCE-u, kada su se u junu srpske snage povukle s Kosova, pripadnici NATO snaga su iz rijeke izvukli kamion, a u njegovom zadnjem dijelu pronađene su kosti. U rijeci su također pronađena i neka tijela.
Prema riječima Roberta McNeila, britanskog forenzičara koji je učestvovao u ekshumacijama u selu 1999. godine, on i njegov tim vidjeli su da su lica žrtava bila prekrivena pocijepanim komadima odjeće, a njihova tijela teško unakažena.
„Nedostajali su im nosovi i uši, a oko gotovo praznih očnih duplji bilo je znakova ozbiljne traume. Sve što je ostalo u očnim dupljama bila je pocrnela, zgusnuta krv tamo gdje su im nekada bile oči”, kazao je McNeila 2023. u intervjuu za BIRN. Među posmrtnim ostacima je bilo i dijece, a njihova tijela, prema njegovim rijećima, su još bila relativno neraspadnuta. „Svako lice je bilo gotovo prekriveno maskom sasušene krvi. Bilo je jasno da su više puta tučeni i upucani”, rekao je on.
Oko 60 ljudi iz sela se i dalje vode kao nestali.