Drugom ekshumacijom 2004. godine, 500 metara od prve, otkrivena je druga grobnica. U njoj su se nalazili posmrtni ostaci 54 ratne žrtve, uključujući 11 djece uzrasta od četiri do 12 godina. Najmlađa žrtva bila je četverogodišnja Naida Hodžić, a najstarija 62-godišnja Fatima Berbić.

Masovne grobnice nisu označene, a nalaze se između krečane zvane Zlatanova Krečana i reke Studeni Jadar.

Vojni i policijski pripadnici Vojske Republike Srpske (VRS) su 16. maja 1992. godine ubili 56 bošnjačkih civila, uključujući žene, djecu i starce. Dvanaest ljudi koji su preživjeli masakr i pobjegli u Vlasenicu pronađeni su i ubijeni u narednim danima. Nakon masakra, s bagerom rudarskog preduzeća “Boksit” iskopane su jame u selu Zaklopača u koje su tijela žrtava bačena.

Amor Mašović, predsjednik Federalne komisije za nestale osobe, rekao je da je među žrtvama u grobnici 29 osoba iz porodice Hodžić.

U martu 2022. godine, Sud Bosne i Hercegovine izrekao je prvostepenu presudu kojom su dvojica bivših policijskih i trojca bivših vojnih pripadnika VRS-a oslobođeni optužbi za učešće u ubistva bošnjačkih civila u Zaklopači. Sud je zaključio da nije van razumne sumnje dokazano da su Radomir Pantić, Nenad Vukotić, Branko Jolović, Milomir Milošević i Nikola Lošić počinili ubistva 1992. godine.

Prema podacima Instituta za nestale osobe BiH, između 1992. i 1995. godine na području općina Vlasenica i Milići nestalo je 955 Bošnjaka.

Najveća masovna grobnica pronađena na području Vlasenice je masovna grobnica Ogradice, iz koje su 2003. godine ekshumirani posmrtni ostaci 232 žrtve. Masovna grobnica Zaklopača je najveća pronađena na području općine Milići, a iz masovne grobnice Sušica ekshumirano je 37 žrtava.